マスターズ甲子園（11月、阪神甲子園球場）へ出場するには、愛知県代表枠、北信越・東海ブロック枠があり、全国高校野球OBクラブ連合の定例総会（11月）において、次年のマスターズ甲子園本大会出場枠が決まります。
愛知県代表枠
全国高校野球OBクラブ連合の定例総会（11月）において申請を希望した加盟都道府県による抽選会を行い、本大会（翌年11月）に出場都道府県が確定します。
愛知県代表枠がある場合は、マスターズ甲子園愛知大会（翌年2月〜）で優勝すると愛知県代表枠で本大会に出場します。
北信越・東海ブロック枠
3年ごとに北信越・東海ブロック枠があり、北信越・東海ブロック大会で優勝すると北信越・東海ブロック枠で本大会に出場します。
北信越・東海ブロック大会に出場するチームは、愛知県代表枠がない年に、マスターズ甲子園愛知大会に優勝したチームが出場します。複数のチームに資格がある場合は、代表決定戦を行い、愛知県代表を決定します。
